隨著高檔紙箱印刷技術的發展，所產生的一系列問題也逐漸增多，主要反映在生產效率低、廢品率高等方面。現在就生產廠家所遇到的問題在此作一些探討。
一般而言，生產效率主要受到前期準備、印刷速度、換版時間等問題的制約。前期準備包括印版的調整、油墨的配備、各個壓力的調整、套色調整等。由于是高檔紙箱的印刷，所以各個環節都要求比較高，相對比較費時、費力。再則，速度由機器的本身決定，一般由于高檔紙箱印刷的套色精度、色彩疊加的要求非常高，所以機器速度不像印刷普通紙箱那么快。另外高檔紙箱的紙板大多比較薄，對送紙機的要求比較嚴格，速度也會因此受到一定的限制。
目前，由于市場產品趨于多品種、小批量的生產，所以換版時間對生產效率的影響越來越大。一般的印刷機都采用軌道式結構，換版、擦版時需要把每色機分開，換版之后再合并在一起，這樣無形中浪費了很多時間。為克服此問題，現在國內外的高檔印刷機，大都采用了單元獨立式結構，機組固定，換版和擦版時，只需打開機組之間的門，就可以完成所有工作，減少了很多時間，提高了生產效率。
除此之外，對于高檔紙箱的印刷，廢品率的高低是非常重要的問題。廢品的產生主要是由于套色不準或顏色疊加不好引起。而套色不準則主要由紙板彎曲，印版的傾斜、伸縮，印刷機設備精度不夠等問題而產生。當然，在生產中紙板多少都會有點變形，我們不能要求它完全平整，所以就需要印刷機在送紙、印刷的整個過程中，盡量的適應并矯正紙板，以達到最好的利用效果。現在高檔印刷機在送紙機部分采用真空吸附，印刷機中間采用吸風式皮帶輸送結構，大大減小了對紙板的要求，取得了很好的效果。另外，印版的傾斜調整也非常重要，高檔紙箱的印刷，對印版要求較高，每色印版不可能安裝時就能保證居中和水平，居中的問題可以通過印刷輥的軸向調整進行調節，但是水平方向一般機器沒法調整。所以在選擇印刷機時，最好選用帶有印版的傾斜調整系統的機器。
顏色疊加效果的好壞有很多因素：設備、油墨、刮刀、紙板、烘干效果、操作人員的印刷經驗等。但是對印刷機而言，顏色疊加的關鍵問題在于著墨。目前市場上高網線印刷機著墨系統主要分兩類：傳統的橡膠輥、網紋輥上墨加刮刀系統和腔室刮刀上墨系統。
傳統的橡膠輥、網紋輥上墨加刮刀系統，采用橡膠輥和網紋輥先行上墨，然后再用刮刀均勻刮墨的方式。這種方式在進行實地印刷或低網點印刷時，可以采用網紋輥和膠輥直接上墨，由于著墨量大，印刷效果較好。當進行高網點印刷時，同時采用刮刀系統，使著墨量均勻，也能達到很好的效果。這可以說明，這種系統適應性比較大，可以通過網紋輥和膠輥之間的壓力、刮刀的壓力調節，在一定范圍內改變網紋輥的含墨量，所以這種系統對高檔紙箱的印刷效果尤其突出。
另外，腔室刮刀上墨系統也是目前大量采用的一種刮墨方式。這種系統比較適用印刷同一網線的產品，但是對于產品網線的更換要求，不容易滿足。因為刮墨腔的壓力直接影響到漏墨的情況，所以壓力可調范圍比較窄，很難通過它調整網紋輥的含墨量。這種結構，如果機器配有網紋輥自動更換系統，根據產品網線的不同，來更換網紋輥，也可以和刮墨腔共同完成高網點的印刷，但這種機型目前國內還沒有。
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